Es erstreckt sich über eine Fläche von 118.144 Hektar (es ist eines der größten Schutzgebiete Italiens). Die vier Tremiti-Inseln (Meeresschutzgebiet) sind Teil des Parks. Im Park befindet sich der Umbra-Wald. Der Gargano besteht hauptsächlich aus Sedimentgesteinen, Kalksteinen und Dolomiten aus der Kreide- und Jurazeit, die größtenteils geschichtet sind und vom Phänomen der Karstauflösung betroffen sind. Eine Ausnahme bildet Punta Pietre Nere, eine Masse aus dunklem Vulkangestein aus der Trias, die am Strand von Lesina auftaucht. Das Karstphänomen, das durch die Einwirkung von Wasser und Kohlendioxid auf die Kalksteinfelsen entsteht, hat die Landschaft auf verschiedene Weise „geformt“. Entlang des gesamten Randes des Kalksteinblocks gibt es große Erosionsfurchen, die radial zum Meer oder zur Capitanata führen. Dabei handelt es sich um felsige Schluchten (verbunden mit dem Phänomen der „Trockentäler“ oder „Täler“), die durch mechanische Erosion und Karsterosion entstanden sind.

Im Gargano-Nationalpark gibt es verschiedene Lebensräume: Buchenwälder im Landesinneren und auf der Nordseite, Aleppo-Kiefernwälder entlang der Küsten, große ausgedehnte mediterrane Macchia, ganz zu schweigen von den Eichenwäldern, in denen es reichlich Truthähne und Steineichen gibt, sowie Mischwälder reich an Eschen, Eschen, Ulmen, Stechpalmen, Kastanienbäumen, Ahornen, Eichen, Buchen usw. Das Unterholz wird von zahlreichen Essenzen bevölkert: Farne, Brombeersträucher, Heckenrosen, Alpenveilchen, essbare und giftige Pilze usw. An den der Sonne ausgesetzten Hängen wachsen Birnen, Melastres und Weißdorn, umgeben von Mastixsträuchern, Wacholder, Thymian, Brombeeren, Kaktusfeigen und dem besonderen „Teufelsbaum“ (Johannisbrot). Im Vorgebirgsgebiet verändert sich die Vegetation radikal und die Steppe überwiegt, reich an Kaktusfeigen, Affodillen, Ferulen, Euphorbien und Schwertlilien; in dem ein ganz besonderer Pilz, Pleurotus eryngii, wächst. Alles wird hier und da von Olivenhainen, Mandelhainen, Weinbergen und Weizenfeldern unterbrochen. Weitere besondere Umgebungen des Gargano sind: die Sümpfe von Federico II, die sumpfigen Gebiete von Frattarolo und die Oase des Salso-Sees, die in zwei Bereiche unterteilt sind: einen, in dem das Sumpfrohr, der Rohrkolben, der Eukalyptus und die Seerose vorherrschen, und der andere, in dem die Flora vorherrscht xerophile oder Queller, Binsen , Tamarisken usw.,die Küstenlagunen, gekennzeichnet durch einen infralitoralen Wald, der auf dem dünnen Sandstreifen wächst, der sie vom Meer trennt (die „Insel“ genannt wird), und in dem die Cistus di clusio und die zahlreichen Schilfdickichte, die sie umgeben, wachsen Banken wachsen. In den innersten Bereichen des Vorgebirges (Wälder von Ischitella, Manatecco, Ginestra, Sfilzi, Umbra, Bosco Quarto, Umereta delle Ripe) gibt es große Wälder aus Buchen, Steineichen, Truthähnen und, manchmal in Verbindung mit Eichen, Ulmen und Eschen . Weitere Wälder von naturalistischem Interesse sind auch die Wälder von Monte Sant'Angelo, Monte Sacro (Mattinata) und Spina Pulci (zwischen San Nicandro Garganico und Cagnano Varano). An der Küste hingegen dominieren die Aleppo-Kiefernwälder, etwa 7.000 Hektar, die sich mit der mediterranen Macchia abwechseln, die reich an Mastixformationen, Phillyrea, Multiflora-Heidekraut und Erdbeerbäumen ist.