Les espaces naturels protégés des Pouilles s'étendent au total sur 245 154,33 hectares[1], dont 75,8 % sont représentés par des parcs nationaux (parc national du Gargano et parc national de l'Alta Murgia) et 8,3 % par des espaces naturels et des réserves naturelles marines.< /p>

Les provinces avec le pourcentage de territoire soumis à protection le plus élevé sont celles de Foggia (51,5%) et de Bari (27,7%)

Aires protégées de la province de Foggia

Le Parc National du Gargano
a été créé avec l'article 34 de la loi du 6 décembre 1991 n. 394. Elle s'étend sur 118 144 hectares (l'une des plus grandes zones protégées). Les quatre îles Tremiti (réserve marine) font partie du parc. A l'intérieur, vous rencontrez les paysages les plus divers : de plus de 2200 espèces botaniques, aux forêts denses et étendues, des hautes falaises surplombant la mer aux grands plateaux karstiques, des gorges escarpées et boisées aux grands lacs côtiers. Les formations végétales les plus importantes que l'on puisse rencontrer sont la forêt de hêtres et la forêt de chênes. Le parc a une riche faune. Ils comprennent jusqu'à 170 espèces d'oiseaux, jusqu'aux oiseaux de proie tels que : la buse variable, la crécerelle, l'épervier, le faucon pèlerin, le hibou grand-duc, le hibou des marais, la chouette effraie, la chouette hulotte et le petit-duc.
Parc naturel régional Bosco Incoronata
créé par la loi régionale n.19 du 19 mai 2006, il s'étend sur environ mille hectares dans la Tavoliere delle Puglie, à 12 km de Foggia. À l'intérieur se trouve le projet de Site d'Importance Communautaire (pSIC) appelé "Valle del Cervaro - Bosco dell'Incoronata" et situé dans la basse vallée du Cervaro.

Petit lac dans la réserve naturelle Foresta Umbra
Autres réserves de la province de Foggia

Réserve naturelle de Falascone
Réserve naturelle de Foresta Umbra
Réserve naturelle d'Il Monte
Réserve naturelle d'Ischitella et Carpino
Réserve naturelle de l'île de Varano
Réserve naturelle du lac Lesina
Réserve naturelle du lac Salso
Réserve naturelle Masseria Combattenti
Réserve naturelle du Mont Barone
Réserve naturelle du marais de Frattarolo
Réserve naturelle des Sfilzi